Quy hoạch đề ra các mục tiêu chính gồm: Không ngừng nâng cao chất lượng dịch vụ cấp nước, đảm bảo an toàn cấp nước, từng bước hiện đại hóa hệ thống sản xuất, quản lý và kinh doanh nước sạch; tỷ lệ dân cư sử dụng nước sạch đến năm 2015 đạt 100% đối với khu vực nội thành cũ và 98% đối với khu vực nội thành mới, khu vực ngoại thành và đến năm 2025 đạt 100%; giảm tỷ lệ thất thoát, thất thu nước sạch đến năm 2015 đạt 32%, đến năm 2025 đạt 25%; cải thiện điều kiện vệ sinh, sức khỏe người dân vùng nông thôn…

Nguồn nước quy hoạch chủ yếu từ sông Đồng Nai, sông Sài Gòn, kênh chính Đông và nguồn nước ngầm trên địa bàn thành phố. Trong đó, giai đoạn đến năm 2025, dự kiến khai thác quy mô công nghiệp nguồn nước ngầm với lưu lượng khoảng 100.000 m³/ngày. Các giếng khoan công nghiệp quy mô nhỏ, giếng khoan hộ gia đình phải ngừng hoạt động theo lộ trình hạn chế khai thác nước ngầm của TP. HCM. 

Dự kiến, chi phí thực hiện Quy hoạch cấp nước TP. HCM đến năm 2025 khoảng 68.000 tỷ đồng. Trong đó, giai đoạn đến năm 2015, đầu tư xây dựng nhà máy nước Thủ Đức III, Tân Hiệp II và mạng lưới đường ống cấp nước khoảng 15.000 tỷ đồng.